-
mRNA測序
產品簡介
轉錄(lu)組測序是通(tong)過高通(tong)量測序技術(shu)全面快(kuai)速的(de)(de)(de)獲(huo)得某(mou)一(yi)物種特定組織(zhi)或器官在某(mou)一(yi)狀態下的(de)(de)(de)幾乎所有轉錄(lu)本序列信(xin)息，包括編(bian)碼RNA和非編(bian)碼RNA，結合生物信(xin)息技術(shu)獲(huo)得RNA的(de)(de)(de)表達和調控信(xin)息，檢測多(duo)種RNA的(de)(de)(de)表達和變(bian)化，同時建立(li)不同類型的(de)(de)(de)非編(bian)碼RNA與mRNA之(zhi)間的(de)(de)(de)調控關系，探索RNA之(zhi)間的(de)(de)(de)相互作用，構建潛在的(de)(de)(de)RNA調控網絡，系統的(de)(de)(de)揭(jie)示(shi)生物現(xian)象背后RNA世(shi)界的(de)(de)(de)轉錄(lu)調控規(gui)律。
技術路線圖
結果展示
基因(yin)表(biao)達量小(xiao)提琴圖（左）； 樣本相關性(xing)圖（中）； 差異表(biao)達基因(yin)火(huo)山圖（右）
差異基因在染色體上(shang)的(de)分布圖(tu)（左）； 差異表達模式聚類圖(tu)（中）； circRNA-miRNA-mRNA網絡圖(tu)（右）
送樣要求
應用方向
應用案例
全轉錄(lu)組測序和(he)蛋白組共同揭示心力衰(shuai)竭關(guan)鍵表達分子和(he)蛋白靶點(dian)
Fibroblast-specific proteotranscriptomes reveal distinct fibrotic signatures of human sinoatrial node in nonfailing and failing hearts
發表(biao)雜(za)志(zhi)：Circulation（IF: 29.690）； 發表時間(jian)： 2021年 7月； 應用(yong)技術： 全轉錄組測序
本研(yan)究(jiu)(jiu)采用從右(you)心(xin)(xin)(xin)(xin)房(fang)(fang)和(he)(he)(he)(he)竇房(fang)(fang)結(jie)(jie)分(fen)離(li)的(de)(de)(de)成(cheng)纖(xian)(xian)維(wei)(wei)細胞(bao)(bao)，經(jing)體(ti)外(wai)培養后進行全(quan)轉(zhuan)錄(lu)組(zu)(zu)測(ce)(ce)序(xu)和(he)(he)(he)(he)定量(liang)蛋(dan)(dan)白(bai)(bai)組(zu)(zu)，繪制(zhi)包括(kuo)信使RNA、非(fei)編碼RNA（lncRNA和(he)(he)(he)(he)miRNA）和(he)(he)(he)(he)蛋(dan)(dan)白(bai)(bai)質(zhi)在(zai)(zai)內的(de)(de)(de)全(quan)面轉(zhuan)錄(lu)-蛋(dan)(dan)白(bai)(bai)組(zu)(zu)表達(da)圖(tu)譜。全(quan)轉(zhuan)錄(lu)組(zu)(zu)測(ce)(ce)序(xu)分(fen)析，發現正(zheng)常心(xin)(xin)(xin)(xin)臟(zang)(zang)和(he)(he)(he)(he)衰(shuai)竭(jie)心(xin)(xin)(xin)(xin)臟(zang)(zang)中竇房(fang)(fang)結(jie)(jie)組(zu)(zu)織(zhi)成(cheng)纖(xian)(xian)維(wei)(wei)細胞(bao)(bao)的(de)(de)(de)mRNA整體(ti)表達(da)模式相似，表明二者(zhe)有共同的(de)(de)(de)信號通路(lu)和(he)(he)(he)(he)分(fen)子(zi)機(ji)制(zhi)。正(zheng)常心(xin)(xin)(xin)(xin)臟(zang)(zang)竇房(fang)(fang)結(jie)(jie)和(he)(he)(he)(he)右(you)心(xin)(xin)(xin)(xin)房(fang)(fang)分(fen)離(li)培養的(de)(de)(de)成(cheng)纖(xian)(xian)維(wei)(wei)細胞(bao)(bao)具有樣本特異性的(de)(de)(de)差(cha)異。另外(wai)，本研(yan)究(jiu)(jiu)還是(shi)首次記錄(lu)人類竇房(fang)(fang)結(jie)(jie)組(zu)(zu)織(zhi)成(cheng)纖(xian)(xian)維(wei)(wei)細胞(bao)(bao)所特有的(de)(de)(de)長鏈非(fei)編碼lncRNA。在(zai)(zai)加入TGF-β的(de)(de)(de)組(zu)(zu)別比(bi)較中，miRNA在(zai)(zai)正(zheng)常心(xin)(xin)(xin)(xin)臟(zang)(zang)和(he)(he)(he)(he)衰(shuai)竭(jie)心(xin)(xin)(xin)(xin)臟(zang)(zang)中竇房(fang)(fang)結(jie)(jie)組(zu)(zu)織(zhi)中呈現出(chu)明顯差(cha)別的(de)(de)(de)表達(da)模式。這(zhe)項研(yan)究(jiu)(jiu)通過分(fen)子(zi)和(he)(he)(he)(he)蛋(dan)(dan)白(bai)(bai)質(zhi)靶點(dian)綜合圖(tu)譜，建立人心(xin)(xin)(xin)(xin)臟(zang)(zang)竇房(fang)(fang)結(jie)(jie)成(cheng)纖(xian)(xian)維(wei)(wei)細胞(bao)(bao)蛋(dan)(dan)白(bai)(bai)-全(quan)轉(zhuan)錄(lu)組(zu)(zu)數據(ju)庫(ku)。這(zhe)些數據(ju)可用于(yu)識別分(fen)子(zi)和(he)(he)(he)(he)蛋(dan)(dan)白(bai)(bai)質(zhi)的(de)(de)(de)特征、信號通路(lu)，以(yi)及(ji)心(xin)(xin)(xin)(xin)衰(shuai)患者(zhe)竇房(fang)(fang)結(jie)(jie)纖(xian)(xian)維(wei)(wei)化和(he)(he)(he)(he)心(xin)(xin)(xin)(xin)律失常的(de)(de)(de)潛在(zai)(zai)治療靶點(dian)。
竇房結成纖維細(xi)胞全轉錄組(zu)表達譜組(zu)成（左）； 促纖維化相關的(de)差(cha)異表達的(de)mRNA基(ji)因（右(you)）
lncRNA差(cha)(cha)異(yi)表(biao)達(da)層次(ci)聚類(lei)熱(re)圖分析（左）； miRNA表(biao)達(da)差(cha)(cha)異(yi)表(biao)達(da)層次(ci)聚類(lei)熱(re)圖（右）
