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Mission Bio單細胞(bao)多組學測序（SNV+CNV+蛋白）
背景介紹
單(dan)細(xi)(xi)胞(bao)測(ce)序技術的(de)快速發展極大(da)地加速了(le)生物(wu)醫學(xue)領域(yu)的(de)相關研(yan)究，幫助科研(yan)人員克服(fu)了(le)生物(wu)樣本內異質(zhi)性(xing)等重大(da)挑(tiao)戰，然(ran)而先前(qian)的(de)單(dan)細(xi)(xi)胞(bao)測(ce)序優(you)勢主要集中在高(gao)通量獲取單(dan)細(xi)(xi)胞(bao)轉(zhuan)錄組信息，對于高(gao)通量的(de)捕獲基因組以及多組學(xue)信息較為(wei)欠缺。 Mission Bio Tapestri平臺可以在單(dan)細(xi)(xi)胞(bao)水平，高(gao)通量的(de)檢測(ce)來(lai)自(zi)同(tong)一(yi)細(xi)(xi)胞(bao)的(de)SNV、 CNV以及蛋白質(zhi)數(shu)據(ju)，提供(gong)單(dan)細(xi)(xi)胞(bao)多組學(xue)解決方案，這將進一(yi)步提高(gao)對細(xi)(xi)胞(bao)間異質(zhi)性(xing)的(de)理解，提供(gong)細(xi)(xi)胞(bao)和遺傳(chuan)組成的(de)獨特見解。
單(dan)細胞基因(yin)組測序和傳統測序的區別
技術原理
Tapestri平臺采用(yong)“分子標(biao)簽(qian)”技術(shu)，基(ji)于微流(liu)(liu)控的(de)(de)工作原理，通(tong)過(guo)兩(liang)步油(you)包(bao)水得(de)以(yi)實現。具(ju)體(ti)流(liu)(liu)程(cheng)如(ru)下：用(yong)帶(dai)(dai)(dai)有oligo標(biao)簽(qian)的(de)(de)抗體(ti)對制備(bei)好的(de)(de)單細(xi)胞懸浮液(ye)進(jin)行孵育，細(xi)胞表(biao)面待檢測的(de)(de)蛋(dan)(dan)白(bai)與抗體(ti)發生結(jie)合，然后(hou)單細(xi)胞懸液(ye)進(jin)入Tapestri平臺，通(tong)過(guo)油(you)包(bao)水，每個油(you)滴包(bao)裹(guo)一個細(xi)胞，實現細(xi)胞的(de)(de)分離，在(zai)(zai)油(you)滴內(nei)完(wan)成蛋(dan)(dan)白(bai)的(de)(de)釋(shi)放和(he)細(xi)胞的(de)(de)裂解。然后(hou)進(jin)行第(di)二(er)步油(you)包(bao)水，此(ci)次油(you)包(bao)水主(zhu)要是在(zai)(zai)油(you)滴內(nei)完(wan)成對蛋(dan)(dan)白(bai)oligo和(he)細(xi)胞內(nei)靶向基(ji)因的(de)(de)標(biao)記，使(shi)得(de)來自同一細(xi)胞內(nei)的(de)(de)基(ji)因和(he)蛋(dan)(dan)白(bai)均帶(dai)(dai)(dai)有相同的(de)(de)標(biao)記信息(xi)。接下來油(you)滴裂解，對帶(dai)(dai)(dai)有標(biao)記的(de)(de)基(ji)因和(he)蛋(dan)(dan)白(bai)的(de)(de)oligo進(jin)行測序(xu)，從而獲取單個細(xi)胞內(nei)基(ji)因組(zu)和(he)蛋(dan)(dan)白(bai)質組(zu)的(de)(de)信息(xi)。
抗體-寡核苷(gan)酸偶(ou)聯物用(yong)于(yu)標(biao)記每個細(xi)胞(bao)表面
微流控技術獲取單細胞DNA&蛋(dan)白質(zhi)文庫信息
單細胞DNA+蛋白質組學工(gong)作流程
Mission Bio 單細胞多組學測序（SNV+CNV+蛋白）
結果展示
細(xi)胞分群圖（左）； 聚(ju)類熱圖（中(zhong)）； 小提琴圖（右）
相關性分析(xi)（左）； 突(tu)變共發生魚形圖(tu)（中）； 克隆進(jin)化(hua)分析(xi)（右(you)）
產品優勢
超高通量
可對每(mei)個樣本的5,000-10,000個細胞進(jin)行多組學(xue)分(fen)析；
平臺唯一
目前唯(wei)一的高通量(liang)單細胞DNA（SNV、 InDel、 CNV、 LOH和易位）檢測平(ping)臺，唯(wei)一的高通量(liang)單細胞DNA和蛋
白質聯合檢測平臺；
高靈敏度
能檢測到0.1%亞(ya)克隆，即可(ke)檢測到0.1%細胞群體中(zhong)發生的突變；
流程簡單
工作(zuo)流(liu)程簡單，深度的數據分(fen)析及可視(shi)化(hua)(hua)，一鍵構建細胞水平上突變(bian)圖譜、探索克隆分(fen)布和克隆進化(hua)(hua)等，
實現(xian)DNA和蛋白分(fen)析結果的共呈現(xian)。
定制服務
可(ke)選擇(ze)已有(you)的(de)目錄化Panel，也可(ke)根據研究需求(qiu)進行靶向DNA&蛋白(bai)質panel定(ding)制；
高性價比
與低(di)通量或傳(chuan)統人工操作等(deng)方法相比(bi)，成(cheng)本降(jiang)低(di)數十倍；
經(jing)驗豐(feng)富
百奧(ao)醫藥技術團隊現(xian)已累積100余(yu)種不同組織類(lei)型、數千(qian)余(yu)個樣品的單細胞測序(xu)經(jing)驗。
送樣要求
應用方向
應用案例
單細胞突(tu)變分(fen)析揭示(shi)髓系惡性血液(ye)病的克(ke)隆(long)進(jin)化
Single-cell mutation analysis of clonal evolution in myeloid malignancies
發表雜志：Nature （IF: 49.962）； 發表時間(jian)： 2020年 11月； 應用技術： Mission Bio 單細胞多組學測(ce)序（SNV+CNV+蛋(dan)白(bai)）
骨(gu)髓(sui)惡性(xing)(xing)腫(zhong)瘤(liu)，包括急(ji)性(xing)(xing)骨(gu)髓(sui)性(xing)(xing)白(bai)血病(bing)（AML） 在內，是由造(zao)血干(gan)細(xi)胞和(he)獲得體細(xi)胞突(tu)(tu)變(bian)(bian)的(de)(de)祖細(xi)胞擴展(zhan)造(zao)成的(de)(de)。盡管(guan)bulk測(ce)序可(ke)以(yi)提供有(you)關白(bai)血病(bing)生(sheng)(sheng)物(wu)學和(he)預后的(de)(de)信(xin)(xin)息，但是它無法區分(fen)同一(yi)克(ke)隆(long)(long)(long)中(zhong)(zhong)發(fa)(fa)生(sheng)(sheng)了(le)(le)哪些突(tu)(tu)變(bian)(bian)，也無法準(zhun)確測(ce)量克(ke)隆(long)(long)(long)的(de)(de)復雜性(xing)(xing)或確定(ding)突(tu)(tu)變(bian)(bian)的(de)(de)順序。本(ben)研(yan)究通(tong)過123個患(huan)者的(de)(de)146個樣(yang)本(ben)的(de)(de)單細(xi)胞突(tu)(tu)變(bian)(bian)分(fen)析，揭示了(le)(le)骨(gu)髓(sui)惡性(xing)(xing)腫(zhong)瘤(liu)驅動基因(yin)的(de)(de)克(ke)隆(long)(long)(long)結構和(he)進化。研(yan)究發(fa)(fa)現AML由少(shao)數克(ke)隆(long)(long)(long)控(kong)制，在表觀遺傳(chuan)調控(kong)因(yin)子中(zhong)(zhong)經常發(fa)(fa)生(sheng)(sheng)共突(tu)(tu)變(bian)(bian)。然而，信(xin)(xin)號基因(yin)的(de)(de)突(tu)(tu)變(bian)(bian)通(tong)常頻繁發(fa)(fa)生(sheng)(sheng)在不(bu)同的(de)(de)亞克(ke)隆(long)(long)(long)中(zhong)(zhong)，這(zhe)與克(ke)隆(long)(long)(long)多樣(yang)性(xing)(xing)的(de)(de)增加是一(yi)致的(de)(de)。本(ben)研(yan)究描(miao)繪了(le)(le)每個樣(yang)本(ben)的(de)(de)克(ke)隆(long)(long)(long)軌跡和(he)發(fa)(fa)現了(le)(le)協同促進克(ke)隆(long)(long)(long)擴展(zhan)和(he)控(kong)制的(de)(de)突(tu)(tu)變(bian)(bian)組合，并(bing)將蛋(dan)白(bai)質表達(da)與突(tu)(tu)變(bian)(bian)分(fen)析相(xiang)結合，揭示了(le)(le)體細(xi)胞基因(yin)型和(he)具有(you)免(mian)疫表型的(de)(de)克(ke)隆(long)(long)(long)結構。為了(le)(le)解髓(sui)樣(yang)轉(zhuan)化的(de)(de)發(fa)(fa)病(bing)機理以(yi)及克(ke)隆(long)(long)(long)復雜性(xing)(xing)如何隨疾(ji)病(bing)進展(zhan)而發(fa)(fa)展(zhan)提供了(le)(le)視角。
髓系惡性腫瘤患(huan)者的單細胞DNA測序結果
AML代表性(xing)的遺(yi)傳(chuan)軌跡（左）； 蛋白表達與基因突變關聯（右）
